火麻仁多肽的制備方法有蛋白酶解法、化學合成法以及微生物發酵法等，微生物發酵法屬于生物工程范疇的新技術，通過控制微生物的代謝和發酵使球蛋白轉化為多肽，具有成本低廉、無污染、所得產物產量高、生物成分營養損失少等優點。酶解法最常用于制備火麻仁多肽的方法，其能夠在相適應的反應條件下水解得到特定的多肽，并具有反應條件溫和，可調控的特點。