在適口性方面，木瓜蛋白酶酶解魚溶漿有著無可比擬的優勢。酶解過程精確調控，充分釋放出魚溶漿中蘊含的濃郁且純正的魚香味。這種香味對于嗅覺敏銳的寵物而言極具吸引力，能夠有效刺激它們的嗅覺感受器，進而激發強烈的食欲。研究表明，在多項寵物喂食實驗中，無論是天性挑剔的貓科動物，還是對食物口味較為敏感的犬科動物，面對添加了該酶解魚溶漿誘食劑的食物，采食積極性均顯著提高，進食量也明顯增加。

牛肉味的寵物誘食劑是最受寵物貓犬喜愛的，牛肉味寵物誘食劑主要采用木瓜蛋白酶酶解牛肉生產，那么在生產過程種，關鍵的控制點是什么呢？運用木瓜蛋白酶酶解牛肉生產寵物誘食劑過程中，酶制劑的添加量、反應溫度、酶解時間以及美拉德反應都是關鍵點，合適的比例是做誘食劑的基礎，酶解時間的長短取決于酶解效果。

海參的營養價值很高，但是海參的外皮口感不是很好，而且很容易附著一些臟東西比如泥沙，細菌等。僅僅靠清洗是清理不干凈的，所以海參脫皮就成了一個很困難的問題。利用木瓜蛋白酶處理海參脫皮是很好的一種方式。木瓜蛋白酶可以將海參外皮的結締組織水解，破壞外皮的分子結構，從而使外皮脫落達到去皮的目的。利用酶法對海參進行脫皮，生產海參多肽，越來越受到重視。生物酶解法反應條件溫和，效率高，且操作過程很容易控制，對生產設備的要求也不是很高，從而降低了生產的成本，還提高了海參多肽的結構完整性。在眾多蛋白酶中，木瓜蛋白酶酶解海參制備海參多肽具有很好的酶解效果，其優點有：水解效率較其他蛋白酶高、反應溫度和pH的范圍較其他蛋白酶廣。

羅非魚下腳料中的魚皮、魚鱗都可以用來生產魚膠原蛋白肽，但魚鱗處理起來工序繁瑣，需要脫灰脫鈣處理，在魚膠原蛋白生產過程中多以魚皮膠原蛋白肽為主。運用木瓜蛋白酶酶解羅非魚皮制取膠原蛋白肽的工藝過程中，因木瓜蛋白酶是內切蛋白酶，其酶解原理是在酶制劑作用下切斷魚皮膠原蛋白內部的肽鍵，從而形成短鏈肽，但被切割后的肽鏈斷裂，會使一部分苦味氨基酸基團暴露，從而導致羅非魚皮酶解后制備的膠原蛋白肽口感苦。

酶解牛肉制備寵物誘食劑常使用的蛋白酶種類有：木瓜蛋白酶、堿性蛋白酶、風味酶、寵物誘食劑劑專用酶等。以木瓜蛋白酶酶解牛肉生產寵物誘食劑來說，其酶解的產物口感鮮，但厚味不足、酶解液渣多不徹底，若酶解時間控過長則會產生苦味。主要是因為木瓜蛋白酶是內切酶，其作用點是從內部切斷肽鏈達到小分子肽的轉化，在這個水解過程中，中部的疏水性基團就會被內切木瓜蛋白酶所切斷，繼而導致最終產物出現口感苦的現象。解決采用木瓜蛋白酶酶解牛肉制備寵物誘食劑口感苦的問題，最好的方式莫過去選擇適合的酶制劑產品。

隨著我國海洋養殖和水產品加工能力的不斷提高，生產過程中產生了大量的魚皮及魚鱗等富含膠原蛋白的廢棄物，為了減少魚鱗等水產品下腳料隨意丟棄造成的環境污染問題，同時提高羅非魚產品的附加值，以酶解羅非魚魚鱗為原料,制備膠原蛋白肽，采用木瓜蛋白酶搭配魚鱗膠原蛋白酶解工藝，并分析所得的膠原蛋白性質，得出木瓜蛋白酶酶解羅非魚魚鱗制備的膠原蛋白肽具有較好的吸水性,保水性和起泡穩定性,應用于保健品行業具有良好的應用前景。

豬肉在我國的飲食序列中一直占有較高的地位，作為豬副產品的豬骨頭，營養豐富，含有較高蛋白質、維生素、鈣等，可以作為優質的食品營養源。利用酶解方式得到的豬骨頭酶解液，含有大量的肽類、氨基酸等。酶解法的引入有效提高了骨頭蛋白質的利用率，也進一步提升了蛋白質的營養價值及功能特性。